Colorectal Cancer Panel FFPE Reference Standard
大腸がん（Colorectal cancers: RC）は、2020年現在、がん関連死亡の世界第2位の原因となっています。CRC患者の診断と個別化治療戦略の追求において、分子／遺伝子プロファイリングは極めて重要な役割を果たしています。すべての固形腫瘍と同様に、診断上または予後上関連性のある変異を検出するためには、FFPEサンプリングが望ましい選択です。当社のCRC FFPE精度管理パネルは、CRCに特異的な臨床的に重要な変異を保有する人工細胞株を独自に組み合わせ、慎重に調合されています。このFFPEパネルは患者試料を複製し、AKT1、APC、BRAF、KRAS、PIK3CA、TP53などの主要遺伝子における実用的な変異を検出することを目的としたNGSやその他の分子生物学的手法を検証するための堅牢な精度管理試料として機能します（全遺伝子リストは添付の表を参照）。すべてのRevvity Mimixリファレンススタンダードと同様に、本製品はISO 9001:2015およびISO 13485:2016規格に準拠して製造されています。
バッチ固有の補足的NGSデータ
Colorectal Cancer Panel FFPE Reference Standardには、バッチ固有の補足NGSデータが付属しています。VCFファイルはこちらからアクセスできます。各バッチは、Agilent社のCREV4（Clinical Research Exome）キットを使用し、Illumina社のプラットフォーム上で250 xの深度でシーケンスされ、Illumina社 DRAGEN Somatic Pipelineでマッピング、ソート、バリアントコールが行われています。
Technical Data
Format: FFPE
Fixation Method: 4% PFA (w/v)
Section Size: 15µm
Cell Density: 3 x 108 cells per block. Approx. 3.5 x 105 cells per section
Expected DNA Yield: 400 ng using Promega Maxwell RSC FFPE Plus DNA Extraction kit
Genes covered: ABL1, ALK, AKT1, APC, BRAF, PIK3CA, KRAS, NRAS, PTEN, TP53
Allelic Frequencies: 3.00 - 22.00%
Verified Mutations:
| Gene | DNA sequence change | Amino acid change | Expected allelic frequency (%) |
|---|---|---|---|
| ABL1 | c.1001C>T | p.T315I | 5.00 |
| AKT1 | c.49G>A | p.E17K | 3.00 |
| ALK | c.3522C>A | p.F1174L | 5.00 |
| APC | c.8140C>T | p.R2714C | 22.00 |
| BRAF | c.1799T>A | p.V600E | 4.00 |
| KRAS | c.35G>A | p.G12D | 5.00 |
| NRAS | c.181C>A | p.Q61K | 4.00 |
| PIK3CA | c.1624G>A | p.E542K | 5.00 |
| PTEN | c.388C>T | p.R130* | 5.00 |
| TP53 | c.722C>T | p.S241F | 8.00 |
General information
Storage: 4°C
Shipping: Ambient
Expiration: See all product shelf life information
Intended use: For assay developers, molecular diagnostic labs (Research use only)
Quality control
Allelic frequency: Droplet Digital™ PCR
Quantification: Quantifluor
DNA Integrity: Agarose gel electrophoresis
Manufacturing Quality: ISO 9001:2015 and ISO 13485:2016
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