エクソームシーケンスデータ

エクソームシーケンスデータが幅広く利用可能になりました

 

Horizonの高品質な全エクソーム NGSデータセットをご利用ください。当社のgDNAまたはcfDNAフォーマットのNGSワークフロー用の標準サンプル製品のVariant Call Format (VCF) ファイルをダウンロードし、測定データセットの偽陽性を検出し、真陽性の確認を可能にします。このデータの作成方法、使用方法ついては、ブログをご覧ください。 
VCFは大きく(200MB以上)、テキストベースのファイルで、ご使用のバイオインフォマティクス解析ソフトウェア(bedtools、VCFtoolsなど)を使用して開くことができます。または、7-Zipなどのツールを使用して解凍し、テキストエディター(Sublime Text、Notepad++ など)を使用して開くこともできます。当社のFFPEおよび親細胞株のデータは、Excel形式でダウンロードできます。

 

gDNA 標準サンプル

Catalog number Description HG19 exome data HG38 exome data 
HD802 EGFR Gene-Specific Multiplex Download Download
HD753 Structural Multiplex Download Download
HD793 BRCA Germline I Download Download
HD795 BRCA Somatic Multiplex I Download Download
HD829 Myeloid Download Download
Catalog number Description HG19 exome data HG38 exome data
HD752 Tru-Q 0 (100% Wildtype) Download Download
HD728 Tru-Q 1 Download Download
HD729 Tru-Q 2 Download Download
HD730 Tru-Q 3 Download Download
HD731 Tru-Q 4 Download Download
HD734 Tru-Q 7 Download Download

 

FFPE 標準サンプル

Catalog number Description Exome data file 
HD200 Quantitative Multiplex Download data
HD300 KRAS Quantitative Multiplex Download data
HD301 5% EGFR Quantitative Multiplex Download data

 

cfDNA 標準サンプル

Catalog number Description HG19 exome data HG38 exome data 
HD780 Multiplex I cfDNA set (contains HD776 and HD777)  
HD776 100% Multiplex I Wild Type Download Download
HD777 5% Multiplex I Download Download

 

親細胞株のExomeデータ

当社のシングルプレックス(単一遺伝子)製品には、特定の親細胞バックグラウンドに目的のバリアントが含まれています。Exomeデータには、これらの標準サンプルを分析する際に検出される可能性のある追加の内在性バリアントがリストされています。

Parental cell line Exome data file 
RKO Download data
SW48 Download data
HCT116 Download data