一本鎖RNA、および複数の一本鎖RNAの同時のカスタム合成がこれまで以上に簡単になりました。

ニーズに合ったオリゴヌクレオチドの製品が見つからない場合、当社のオンライン設計ツールと幅広い合成オプションを使用してカスタムRNAを作成することができます。オンラインで簡単に注文できる、さまざまな修飾、サイズ、精製オプションの組み合わせをご用意しています。価格、発送までの日数、カートへの追加はすぐに確認できます。

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一本鎖RNAまたはRNA-DNAキメラのご注文        複数の一本鎖RNAの同時のご注文

オンラインで入手できない標準以外の化学修飾や修飾ヌクレオチドが必要な場合は、価格リクエストフォームにご記入ください。当社Scientific Support teamが内容を確認し、回答いたします。

DharmaconのRNA合成能力は業界標準をはるかに上回っています。
  • 長鎖RNAオリゴ
  • microRNAバイオロジー研究のためのカスタムmicroRNAインヒビター
  • カスタムホスホロアミダイト
  • 特殊な化学修飾または修飾された塩基
  • in vivoおよび前臨床開発のためのより大きなスケールのカスタムRNA

2’Oメチル基、シュード(疑似)ウリジン(~U)、Cy蛍光色素、ブラックホールクエンチャー(BHQ)、ホスホロチオエートバックボーン修飾など、多くの標準的な修飾を提供しています(*)。カスタムホスホロアミダイトの製造は、必要な修飾塩基が市販されていない場合、または当社の化学プラットフォームに化学的に適合させる必要がある場合にリクエストできます。

詳細については、Scientific Supportにお問い合わせください。

 

Dharmacon RNAオリゴヌクレオチドは、80nt以上の長さを日常的に合成しており、一貫性があり、優れた純度レベルを誇ります。
purified 99 mer

より長いオリゴを合成する能力は、2次構造が形成される可能性や、特定の配列の化学合成が本質的に難しいことなどから、配列に大きく依存します。 

オリゴの長さが長くなるほど、全体的な収量が減少することが予想されます。

 

 

RNAオリゴは、次のような目的で使われています。
Single-strand RNA RNAを用いたアプリケーション
カスタムmicroRNAインヒビター in vitroまたはin vivoアプリケーション
アプタマー ウイルス学
リボザイム miRNA機能研究
tRNAs X線結晶学、NMR
FISH/ISH プローブ RNAi
FRET プローブ 転写/翻訳
RNA/DNA ハイブリッド アッセイ開発
カスタム二本鎖RNA マイクロアレイ
ダイサー基質 RNAを介した細胞メカニズム
アンチセンスオリゴ RNA/タンパク質相互作用
酵素基質 RNAケミストリー

一本鎖RNAは、安定性を向上させるために2’保護された形でお届けすることも可能です。

RNAを化学合成した場合、すべてのオリゴヌクレオチドは各ヌクレオチドの2’位に化学的保護基を持ちます。

Dharmacon の2'-ACEケミストリーは、カスタムRNA合成のなかでもユニークなもので、保護されたフォームで製品お届けするオプションは他ではみられません。2’位で保護されたRNAの使用には利点があります。
  • 脱保護の前に、オリゴに対して追加の化学的操作を実行できます。
  • 最終製品に付与されるヌクレアーゼ耐性の強化を実現しました。
  • 長期保管中の水溶性と安定性を維持できます。
  • 弱酸性条件下で保護基を簡単に除去できます。
保護されたRNAは、使用前に脱保護する必要があります。RNAオリゴを脱保護するためには、以下の2つのオプションから選択してください。
  1. お客様の研究室で脱保護反応を実行します(default)
    簡単な30分の手順です。保護解除バッファーはご注文時に無償で提供されます。プロトコールはこちらをご覧ください。 
  2. 出荷前にRNAオリゴを脱保護することも可能です。
    少額の手数料で、再懸濁後に「すぐに使用できる」状態のオリゴをお届けすることも可能です。RNAの脱保護の私共へのご依頼を希望される場合は、注文時に「2’-Deprotect / Desalt(2’-脱保護/脱塩)」チェックボックスをオンにしてください。
  Acid-catalyzed reaction

 

Dharmaconは、カスタムsiRNAおよびRNAオリゴヌクレオチドの蛍光標識用の色素修飾を幅広くご用意しています。

  • RNAオリゴの3'、5'位、または内部位置用の蛍光タグ
  • シーケンス内の位置によって制限されない、単一オリゴ内の複数のラベルも可能です。
  • ほとんどの色素標識オリゴの合成は、グラム量までスケール化可能です。

オンラインで設計可能な蛍光色素:

*一部の3’色素ラベルは、ご要望の場合にのみ利用できます。
Fluorophore λ max abs (nm) λ max em (nm) Comparable to 5' or 3'
Fluorescein / 6-FAM 494 520 - both*
TAMRA 565 580 - both*
Cy3 547 563 - both*
Cy5 646 662 - both*
Cy5.5 688 707 - both*

35 nt未満の未修飾一本鎖RNAでは、通常80〜85%の純度を達成しています。ただし、化学合成されたRNAオリゴヌクレオチドが次の場合は精製が推奨される場合があります。

  • 極めて長鎖の場合(長さが 40~50 nt以上)
  • 3’末端または内部で化学的に修飾されている場合
  • 二重で標識されている場合
  • 高感度アッセイまたはin vivoアプリケーションでの使用を目的とする場合

未精製材料のための精製方法または純度推定に関する推奨事項については、Scientific Supportにお問い合わせください。

RNAの精製と処理のオプション

  Unprocessed Desalt/Deprotect PAGE HPLC In vivo In vivo HPLC
Deprotected   * *
Desalted   * *
Endotoxin tested        
Sodium counter-ion exchange        
Recommended for 3' or dually labeled RNA      
Recommended for in vivo use        

* PAGEおよびHPLC精製オプションは、脱塩/脱保護の有無にかかわらずリクエストできます。

RNA処理法について

  • Unprocessed(未処理):RNAオリゴは合成後の処理を受けていません。脱塩、脱保護、精製されていません。
  • Desalted(脱塩):RNAオリゴは、エタノール沈殿またはC18カラム脱塩のいずれかによって脱塩されています。カラム脱塩は通常、PAGE精製されたRNAおよび長さが10nt未満のRNAに使用されます。
  • Deprotected(脱保護):RNA塩基の2′-ACE保護基が除去(脱保護)されています。
  • PAGE:RNAオリゴはポリアクリルアミドゲル電気泳動で精製されています。
  • HPLC:RNAオリゴは、精製のためにイオン交換高速液体クロマトグラフィーを受けています。
  • in vivo:RNAオリゴは、対イオン(Na +)交換、脱塩、滅菌ろ過、およびエンドトキシンテストによって処理されています。
  • in vivo HPLC:RNAオリゴはin vivoプロセッシングとHPLC精製の両方を受けています。