Cas9 ヌクレアーゼ誘導発現用レンチウイルス粒子によるゲノム編集のタイミングの制御



Cas9発現の一時的な制御を可能にするレンチウイルスベクターは、Cas9の構成的発現を回避しながら、必須遺伝子の機能を解明することができます。

    temporal control image
  • Cas9発現とゲノム編集の時間的制御
  • 編集された細胞の濃縮が容易
  • 高い精度、および実験の柔軟性が向上

 

 

Edit-R™誘導型レンチウイルスCas9発現ベクターは、哺乳類細胞におけるゲノム編集に必要なCRISPR-Cas9システムの2つの重要なコンポーネントの1つであるCas9ヌクレアーゼ酵素に基づいています。Edit-R誘導型レンチウイルスCas9発現ベクターは、目的の遺伝子を標的とするように設計されたEdit-RレンチウイルスsgRNAと組み合わせて使用され、最適化されたドキシサイクリン誘導型システムを使用して遺伝子ノックアウトの時間的制御を行うことができます。

Illustration of CRISPR-Cas9 system
CRISPR-Cas9システム
Figure 1. CRISPR-Cas9システム。sgRNAの標的配列(緑)によってプログラムされたCas9ヌクレアーゼ(水色)は、PAM(赤)の5 '側のゲノムDNAの位置で両鎖を切断します。

Cas9発現とゲノム編集の時間的制御

Edit-R誘導型レンチウイルスCas9発現ベクターには、応答性の高いTet-On®3Gドキシサイクリン誘導型プロモーターの制御下にあるCas9遺伝子のヒトコドン最適化バージョンが含まれています。これにより、正確に指定された時間に最適化された濃度のドキシサイクリンで処理することにより、遺伝子ノックアウトを実行することができます。最小限の基礎発現でCas9発現の厳密な調節を可能にするだけでなく、Edit-R誘導型レンチウイルスCas9発現ベクターは、非常に低用量のドキシサイクリンでも、誘導時に強力な活性化を提供します。

 

inducible lentiviral cas9 nuclease reagent data
誘導型U2OS-Cas9細胞におけるドキシサイクリンの用量反応
Figure 2. 細胞に誘導型(TRE3G-Cas9)Cas9発現レンチウイルス粒子をMOI 0.3で形質導入し、テトラサイクリンを含まない培地で10 µg/mLブラストサイジンで10日間選択しました。次に、Cas9安定発現細胞に、PPIB-sgRNAレンチウイルス粒子をMOI 0.3にて形質導入しました。細胞を2µg/mLのピューロマイシンおよびテトラサイクリンを含まない培地で4日間選択し、トリプシン処理で細胞を浮遊させ、ドキシサイクリンの濃度を増加させた培地(0〜1000 ng/mL)の96ウェルプレートに播種しました。細胞を72時間インキュベートし、溶解し、T7EIを用いたDNAミスマッチ検出アッセイを使用してindel(挿入および欠失)について分析しました。上図:PPIBターゲットアンプリコンに対するT7EIを使用したDNAミスマッチ検出アッセイの代表的なゲル画像。下図:3つの独立して処理されたウェルからのゲノム編集の推定パーセンテージの平均±標準偏差を示すひげ図。

 
編集細胞の濃縮

ブラスチシジン耐性遺伝子(BlastR)を構成的に発現させることにより、Edit-R誘導型レンチウイルスCas9発現ベクターは、sgRNA形質導入の前にCas9発現細胞の選択を可能にします。これにより、機能的ノックアウトを同定するためのダウンストリーム研究に利用できるゲノム編集細胞の割合が増加します。

Gene knockout workflow using the Edit-R™ Inducible Lentiviral Cas9 Nuclease with Edit-R™ Lentiviral sgRNA.
レンチウイルスsgRNA
Figure 3. Edit-R™誘導型レンチウイルスCas9ヌクレアーゼとEdit-R™レンチウイルスsgRNAを使用した遺伝子ノックアウトワークフロー

 
高い精度、および実験の柔軟性が向上

Edit-R誘導型レンチウイルスCas9発現ベクターは、誘導されたときにCas9ヌクレアーゼの強力な発現を提供し、オフ状態では最小限のプロモーター転写を提供するため、ゲノム編集が高い精度で行われます。目的の遺伝子を標的とするEdit-RレンチウイルスsgRNAと組み合わせて使用できるため、最大限の柔軟性が得られます。

 

Written by Ryan Donnelly, Senior Product Manager
Ryan Donnelly headshot

Ryanは、2年間、Horizonでゲノム編集試薬ポートフォリオを主導し、CRISPRゲノム編集を使用する研究者のニーズを探索し、実験を簡素化して作業を進めるための製品を開発してきました。Horizon以前は、Canon BioMedicalで製品マネージャーとして働いており、遺伝性疾患の検査方法の臨床応用に注力していました。彼はジョージワシントン大学で分子バイオテクノロジーの専門科学修士号を、フロリダ大学で化学の学士号を取得しています。

 

 

Cas9 ヌクレアーゼ誘導発現用レンチウイルス粒子アプリケーションページをご覧ください。

Inducible lentiviral Cas9

 

製品の詳細については、テクニカルマニュアルをダウンロードしてください。

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