Pan-Cancer 6-Fusion Panel
Pan-Cancer 6-Fusion Panel FFPE RNA標準サンプルは、特性のよく明らかにされている臨床的意義のある細胞株由来の精度管理試料であり、融合遺伝子の検出を目的としたターゲットNGS RNA-Seq、endpoint reverse-transcription PCR（エンドポイントRT-PCR）、RT-qPCR およびRT-ddPCRアッセイの性能評価のために使用します。
各15 µm切片にはホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）された複数の細胞株のミックスが含まれており、トランスクリプトーム解析で6つのキナーゼ関連融合RNAが含まれていることが確認されています。
Product Highlights
- ALK、RET、ROS1、および３つのNTRK融合遺伝子を含む
- 臨床サンプルに類似した100%細胞株由来の標準サンプル
- バッチ間ばらつきの小さい一貫性
- NGSアッセイワークフローの性能評価にも適する
- 対象変異はデジタルPCRにより定量済み
- ISO 9001認証に基づく製造
Technical Data
フォーマット：FFPE
対象遺伝子：TPM3-NTRK1, QKI-NTRK2, ETV6-NTRK3, EML4-ALK, CCDC6-RET, SLC34A2-ROS1
固定方法：10%ホルマリン
切片サイズ：15 µm
ユニットサイズ：1 x 15 µm FFPE切片
保管温度：4℃
有効期限：product shelf life informationを参照してください。
Product Information
検証済み変異：
| 5' Partner | 5' Partner Chromosome | 3' Partner | 3' Partner Chromosome | RNA Expression Level |
|---|---|---|---|---|
|
TPM3(Exon 7) |
1 |
NTRK1(Exon 10) |
1 |
≥100 Copies/ng |
|
QKI(Exon 6) |
6 |
NTRK2(Exon 14) |
9 |
≥100 Copies/ng |
|
ETV6(Exon 5) |
12 |
NTRK3(Exon 15) |
15 |
≥4 Copies/ng |
|
EML4(Exon 13) |
2 |
ALK(Exon 20) |
2 |
≥40 Copies/ng |
|
CCDC6(Exon 1) |
10 |
RET(Exon 12) |
10 |
≥4 Copies/ng |
| SLC34A2(Exon 4) |
4 |
ROS1(Exon 32) |
6 |
≥40 Copies/ng |
使用目的: アッセイの検証、およびアッセイの日常の品質・精度管理用（研究用試薬）
Quality Control
抽出可能なRNAまたは期待される収量：Maxwell RSC® RNA FFPE Purification Kit（Promega）を使用時、1切片あたり100 ng以上のRNA
RNA定量法：Qubit® RNA HSアッセイ（Thermo Fisher Scientific）
融合遺伝子発現：TPM3-NTRK1、QKI-NTRK2、ETV6-NTRK3、EML4-ALK、CCDC6-RET、およびSLC34A2-ROS1 RNA転写産物の発現は、QX200 ddPCRシステム（Bio-Rad）を使用した融合遺伝子特異的RT-ddPCRにより確認
RNAの品質：TapeStation High Sensitivity RNA ScreenTape Assay（Agilent）を使用時、期待されるDV200値は65％以上
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