CRISPRmod CRISPRi all-in-one lentiviral sgRNA 全ゲノムプール化ライブラリー

CRISPRi all-in-oneプール化レンチウイルスライブラリーを用いて、転写レベルで数千の遺伝子を抑制することができます。

all-in-oneフォーマットのCRISPRmod CRISPRiライブラリーは、高い遺伝子転写抑制効果により、効率的な全ゲノムスクリーニングを実現し、遺伝子研究や治療法の発見を促進します。

CRISPRmod CRISPRiシステムは、CRISPRi sgRNAと転写抑制因子SALL1-SDS3が融合した、切断活性が不活化されたCas9（dCAS9）の2つのコンポーネントを必要とします。

dCas9-SALL1-SDS3は、一般的に使用されているdCas9-KRABシステムよりも、ゲノム全体にわたってよりロバストで一貫した遺伝子抑制を実現するために開発されました。

プロモーター（mCMVおよびhEF1α）の選択により、目的の細胞における最適なdCas9-SALL1-SDS3発現が可能になります。

CRISPRmod CRISPRiガイドRNAデザインは、公開されているCRISPRi v2アルゴリズム（Horlbeck et al 2016）を使用して設計されています。CRISPRiガイドRNAは、標的遺伝子の転写開始点（TSS）のすぐ下流の遺伝子配列に結合して転写を抑制します。

CRISPRmod CRISPRi all-in-one lentiviralベクターマップ
Schematic map of the CRISPRmod CRISPRi All-in-one lentiviral vector
Highlights:
  • dCas9-SALL1-SDS3および遺伝子特異的sgRNA抑制の両方に単一のレンチウイルスベクターを使用する効率的なall-in-oneベクターシステム
  • 効率的かつ特異的な遺伝子抑制をもたらす合理的に設計されたレンチウイルスsgRNA
  • ヒトゲノム全体にわたり、1遺伝子あたり4または8個のsgRNAで深く広いカバレッジを実現し、ヒットの信頼性を向上
  • 生物学的に関連性のある細胞タイプでロバストな不活性化を行うための複数のプロモーターオプション
  • 最小限の細胞毒性で直接導入するために濃縮、精製された高品質の ≥ 2 × 107 TU/mL（± 20%）レンチウイルス粒子
各CRISPRmod CRISPRi all-in-one lentiviral pooled screening libraryには、次のものが含まれています：
  • ≥ 2 × 107 TU/mL（± 20%）レンチウイルス粒子、10 × 100 uLアリコート、mCMVまたはhEF1αプロモーターオプション付き
  • ヒトゲノムのどの遺伝子ともアライメントしない（標的化しない）ことがバイオインフォマティックに確認された最大100個のnon-targeting gRNAネガティブコントロール
  • 遺伝子アノテーション、sgRNAターゲット配列、完全なコントロールリスト、数百万マップリードあたりのカウントを含む完全なライブラリー情報を含むデータファイル
当社の検証済みプロトコールで推奨されている製品：
  • トランスダクションの最適化とプロモーター選択のためのベクター対応CRISPRi EGFPデリバリーコントロール
  • NGS Hit Identification primers （mCMVまたはhEF1α ベクター用）：
    • バイアスを最小限に抑えたゲノムDNAの効率的なPCR増幅
    • NGSランに多様性をもたらすスタッガードフォワードプライマー
    • 部分的なIllumina®互換TruSeq®アダプターの追加  
Edit-R Lentiviral sgRNA プールライブラリーのカバレッジに関する情報

遺伝子数およびコンストラクト数は予告なく変更される場合があります。クローン数および遺伝子数はご要望に応じてご提供いたします。Scientific Supportへお問い合わせください。