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Edit-R Synthetic crRNA(化学合成 crRNA)ライブラリー
アルゴリズムで最適化されたガイドRNAでライブラリーの特異性を確保

Edit-R™ crRNAライブラリーを使用したCRISPR-Cas9ゲノム編集で、機能ゲノミクス研究を推進してください。遺伝子ごとに複数の標的部位に対してデザインしたcRNAを用いて数百の遺伝子を分析します。全ゲノム、ヒトDruggableゲノムもご用意しています。
アレイ化ライブラリーフォーマットにより、ハイコンテントアッセイやその他の形態学的またはレポーターアッセイなどの多くの表現型アッセイが単一ウェルで可能になります。
すべての化学合成crRNA製品を使用するには、Edit-R synthetic tracrRNA™が必要であることにご注意ください。
Highlights:
- crRNA は、Edit-R™ アルゴリズムによって選択されます。高機能であり、特異的な配列を標的とするため、堅牢で信頼性の高い遺伝子ノックアウトを実現します。ヌクレアーゼ耐性を改善するために化学修飾しています。
- 信頼性の高い表現型の結果を得るために、遺伝子ごとに4つの配列の異なるcrRNAデザインがデザインされ、個別またはプール(混合)された試薬として提供されます。
- 96ウェルまたは384ウェルプレートにアレイ化された遺伝子ファミリーコレクションとしてご用意しています。ご要望に応じて、Echo-qualified 384ウェルプレートをご利用可能です。
- ご自身のご希望の遺伝子リストをアップロードしてプレートをカスタマイズできるcrRNA cherry-pickライブラリーもご利用いただけます。
Human Druggableは、Proteases、Protein Kinases、Phosphatases、Transcription Factors、Ubiquitin Enzymes、GPCRs、Ion Channels and Drug Targetsで構成されています。
Human crRNA Libraries | # genes (approximate) | Catalog # (Pool/Set of 4) |
---|---|---|
Human Edit-R™ - Cell Cycle Regulation | 169 | GP/GC-003205-xx |
Human Edit-R™ - Cytokine Receptors | 110 | GP/GC-004005-xx |
Human Edit-R™ - Deubiquitinating Enzymes | 94 | GP/GC-004705-xx |
Human Edit-R™ - DNA Damage Response | 240 | GP/GC-006005-xx |
Human Edit-R™ - Drug Targets | 3686 | GP/GC-004650-xx |
Human Edit-R™ - Druggable Genome | 8422 | GP/GC-004605-xx |
Human Edit-R™ - Epigenetics | 835 | GP/GC-006105-xx |
Human Edit-R™ - G Protein-coupled Receptors | 390 | GP/GC-003605-xx |
Human Edit-R™ - Genome | 19,127 | GP/GC-005005-xx |
Human Edit-R™ - Ion channels | 417 | GP/GC-003805-xx |
Human Edit-R™ - Membrane Trafficking | 140 | GP/GC-005505-xx |
Human Edit-R™ - Nuclear Receptors | 52 | GP/GC-003405-xx |
Human Edit-R™ - Phosphatases | 248 | GP/GC-003705-xx |
Human Edit-R™ - Proteases | 527 | GP/GC-005105-xx |
Human Edit-R™ - Protein Kinases | 746 | GP/GC-003505-xx |
Human Edit-R™ - Transcription Factors | 1580 | GP/GC-005805-xx |
Human Edit-R™ - Tyrosine Kinases | 90 | GP/GC-003105-xx |
Human Edit-R™ - Ubiquitin Enzymes | 738 | GP/GC-006205-xx |
Mouse crRNA Libraries | # genes (approximate) | Catalog # (Pool/Set of 4) |
Mouse Edit-R™ - Cell Cycle Regulation | 105 | GP/GC-013200-xx |
Mouse Edit-R™ - Cytokine Receptors | 139 | GP/GC-014000-xx |
Mouse Edit-R™ - Deubiquitinating Enzymes | 100 | GP/GC-014700-xx |
Mouse Edit-R™ - Epigenetics | 724 | GP/GC-016100-xx |
Mouse Edit-R™ - GProtein-coupled Receptors | 515 | GP/GC-013600-xx |
Mouse Edit-R™ - Ion Channels | 340 | GP/GC-013800-xx |
Mouse Edit-R™ - Membrane Trafficking | 113 | GP/GC-015505-xx |
Mouse Edit-R™ - Nuclear Receptors | 46 | GP/GC-013400-xx |
Mouse Edit-R™ - Phosphatases |
273 | GP/GC-013700-xx |
Mouse Edit-R™ - Proteases | 599 | GP/GC-015100-xx |
Mouse Edit-R™ - Protein Kinases | 774 | GP/GC-013500-xx |
Mouse Edit-R™ - Transcription Factors | 1419 | GP/GC-015800-xx |
Mouse Edit-R™ - Tyrosine Kinases | 92 | GP/GC-013105-xx |
Mouse Edit-R™ - Ubiquitin Enzymes | 752 | GP/GC-016200-xx |
化学合成crRNA:tracrRNAによるPLK1およびKIF11のノックアウト時の有糸分裂指数の増加

U2OS-(Ubi)EGFP -Cas9安定発現細胞を5,000細胞/ウェルで96ウェルプレートに播種し、翌日、PLK1およびKIF11を標的とする25 nM濃度の4つの異なるcrRNA:tracrRNA複合体をトランスフェクトしました。4つのnon-targeting crRNAコントロール(NTC)、脂質のみでトランスフェクトされた細胞(Lipid)、または未処理細胞(untreated: UT)をネガティブコントロールとして使用しました。トランスフェクション後48時間で細胞を固定し、抗Phospho-Histoneh6抗体(DY550二次抗体)およびHoechst 33342で染色しました。INCell Analyzer 2200イメージングシステム(GE Healthcare)で細胞画像を分析し、Phospho-Histone h6の有糸分裂指数(Mitotic Inde: MI)は、non-targeting crRNAの平均MIに対して正規化されました。
化学合成crRNA:tracrRNAによるPLK1およびKIF11ノックアウト時の有糸分裂マーカーで染色された細胞の増加

U2OS-(Ubi)EGFP-Cas9安定発現細胞を5,000細胞/ウェルで96ウェルプレートに播種し、翌日、PLK1またはKIF11を標的とする25nM crRNA:tracrRNAでトランスフェクトしました。non-targeting crRNA(NTC1)または脂質のみで処理した細胞をネガティブコントロールとして使用しました。トランスフェクションの48時間後に細胞を固定し、抗Phosho-Histoneh6(Ph6)抗体(DY550二次抗体)およびHoechst 33342で染色しました。細胞の画像は、INCell Analyzer 2200イメージングシステム(GE Healthcare)で撮影しました。核(青)とPh6(赤)蛍光シグナルのの合成画像。
化学合成crRNA:tracrRNAによる必須遺伝子のノックアウトはアポトーシスをもたらす

U2OS-(Ubi)EGFP-Cas9安定発現細胞を10,000細胞/ウェルで96ウェルプレートに播種し、翌日、PLK1、KIF11、BCL2L1をターゲットとするの4つの異なるcrRNA:tracrRNA複合体を25 nM濃度でトランスフェクトしました。4つの異なるnon-targeting crRNAコントロール(NTC)も同様にトランスフェクションしました。脂質のみでトランスフェクトしたウェル(Lipid)または未処理細胞(untreated: UT)もコントロールとして含めました。アポトーシスに対する効果は、トランスフェクションの48時間後にCasp3/9 homogeneousアッセイ(ApoONE、Promega)を使用してアッセイされました。データは、non-targeting crRNA(NTC1)の平均値に正規化されています。
化学合成crRNA:tracrRNAによるPLK1およびKIF11のノックアウト後に観察された細胞死表現型

U2OS-(Ubi)EGFP-Cas9安定発現細胞を10,000細胞/ウェルで96ウェルプレートに播種し、翌日、PLK1およびKIF11を標的とする4つの異なるcrRNA:tracrRNA複合体を25 nM濃度でトランスフェクトしました。non-targeting crRNA #1(NTC-1)またはPPIB crRNAをネガティブコントロールとして使用しました。明視野画像は、トランスフェクションの48時間後に撮影されました(20x、ライカDMIL顕微鏡)。
Cas9発現細胞と化学合成crRNA:tracrRNAを使用した遺伝子ノックアウトワークフロー

crRNAライブラリーワークフローで最適な結果を得るには、ノックアウト効率を向上させるためにCas9ヌクレアーゼの安定した発現を確立することをお勧めします。その後のcrRNA:tracrRNAのトランスフェクションは非常に簡単で、ハイスループットで行うことができます。
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Protocols
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Related Products
Ready-to-use, RNase-free Tris-HCl buffer for resuspension of synthetic crRNA and tracrRNA molecules
Catalog ID:B-006000-100
Unit Size:100 mL
$51.00
The OptiPlate™ is PerkinElmer’s most versatile microplate, used in many different applications, assays, and instruments. The optimized well design and high-quality plastics provide low background and crosstalk.
The CulturPlate is PerkinElmer's microplate designed for cellular assays, tissue-culture treated and sterilized by gamma-irradiation to facilitate adherent cell growth. The optimized well design and high-quality plastics provide low background and crosstalk
The PhenoPlates line of microplates have been engineered to deliver both performance and superior images for high-content application