CRISPR KO application note
CRISPR-Cas9スクリーニングは標的同定にどのように使用できるかについて、ご一読ください。
10年以上のCRISPRゲノム編集サービスの専門性を活用し、創薬標的の同定や遺伝子機能の探索を可能にする、信頼性が高く効率的なCRISPRノックアウトスクリーニングを実現します。
私たちのCRISPR KOスクリーニングサービスは、高性能なオールインワンベクターシステムを使用し、遺伝子発現の完全な消失を実現します。完全に最適化されたスクリーニングプラットフォーム、洗練されたバイオインフォマティクス解析、複数の既製ライブラリーおよびカスタムライブラリーにより、創薬を進めるための適切で信頼性の高いデータを得ることができます。
CRISPRノックアウトスクリーニングサービス
CRISPRノックアウトスクリーニングは、遺伝子発現の完全な消失を可能にするアプローチであり、表現型への影響のための最大限のウインドウとヒット発見のための高い統計的検出力を提供します。細菌由来のCRISPRに関連するCas9ヌクレアーゼとプール化シングルガイドRNA（sgRNA）の組み合わせを利用することにより、高いオンターゲット特異性で、効率的な完全ノックアウトが実現できます。
CRISPRノックアウトスクリーニングの用途
- 薬物標的の特定と優先順位付け
- 細胞の生存能力、薬剤感受性または耐性に必要な遺伝子の探索発見
- 臨床試験のための患者層別化
- 潜在的な併用療法のための標的または経路の特定
CRISPR KOプラットフォーム
私たちのCRISPRノックアウトスクリーニングプラットフォームは、10年以上にわたって開発・最適化され、業界をリードする高度に洗練されたプラットフォームとして選ばれています。当社のCRISPR KOシステムは、当社のオールインワンベクターシステムを使用することにより、細胞株の選択から最適化、スクリーニング結果のバイオインフォマティクス解析まで、迅速なワークフロー（Cross et al, 2016）で性能の向上を実現しています。以下のような受託サービスをご相談いただけます。
- プール化レンチウイルス、またはアレイ化化学合成試薬のオプション
- デザイン済みsgRNAの組み合わせ済みライブラリーまたはカスタムデザイン
- 細胞表面マーカー、シグナル伝達および代謝
- デユビキチン化酵素 & 薬剤標的
- キナーゼ & DNA損傷応答
- エピジェネティクス & オートファジー
- Edit-R™ アルゴリズムデザインを活用した全ゲノムライブラリー
- 最適化済み細胞株リストからの細胞株、またはスクリーニング前の細胞株評価
- カスタマイズ可能なスクリーニングデザインとリードアウトオプション
- 次世代シークエンシングとバイオインフォマティクス解析によるヒット候補の提示
- 12～20週間のプロジェクトタイムライン
CRISPRノックアウトスクリーニングの納品物：
- 阻害／活性化により対象化合物に対する応答が変化する遺伝子のリスト
- 実験デザイン、すべての生データと解析データ、解析の結論を含む最終報告書
CRISPR ノックアウトのケーススタディーデータ
MAGeCKヒットコーリングアルゴリズムによるスクリーニングヒットのランキング。y軸は、ベムラフェニブ投与後の濃縮度について、RRA（robust ranking aggregation）値で遺伝子をランク付けした。さらに、同じ遺伝子を標的とするsgRNAの平均log2-fold変化をx軸にプロットした。
機能ゲノミクススクリーニングサービス
標的の選択から患者の層別化まで、治療標的の同定と特性解析に役立つ機能的ゲノム解析サービスをすべてご覧いただけます。